Определение степени нефтяного загрязнения с помощью детекции определенных бактериальных генов в образцах из окружающей среды

судно: НИС «Профессор Мультановский»
отряд: морской биологии
район исследований: Дальневосточные моря России
даты: август-сентябрь 2024 г.

Актуальность задачи: В последнее время отмечено хроническое загрязнение морских акваторий полуострова Камчатка нефтепродуктами, фенолами, солями тяжелый металлов, радиоактивными веществами. Нефтепродукты относятся к числу наиболее распространенных и опасных веществ, загрязняющие поверхностные воды. Загрязнение нефтепродуктами отрицательно сказывается как на качестве воды, так и на состоянии водного объекта в целом. Наиболее быстро на изменение качества окружающей среды реагируют микроорганизмы. При поступлении загрязняющего вещества в водный объект в нем развиваются специфические группы бактерий, которые используют их в качества энергетического и конструктивного субстрата. На этом принципе основан метод микробной индикации. Микроорганизмы различных таксономических групп, способные к деструкции углеводородов, являются природными очистителями загрязненных нефтью экосистем. Детекция определенных бактериальных генов в образцах из окружающей среды может служить надежным маркером присутствия в ней углеводородокисляющей микробиоты и наличия источника нефтяного загрязнения.

Даниил Дашков. Являюсь аспирантом направления «Микробиология», мои научные интересы являются углеводородокисляющие микроорганизмы холодных морей, а именно их биоразнообразие и метаболический потенциал. Также мной рассматриваются гены ответственные за деструкцию разных фракций нефти. Участвовал во всероссийских и международных конференциях. Являюсь соавтором нескольких баз данных, а также статей рецензируемые ВАК и WoS.

Опубликованные работы по теме задачи:
1. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2023624998 Российская Федерация. Распространение генов окисления углеводородов нефти в морских бактериальных сообществах п-ва Камчатка : № 2023624703 : заявл. 13.12.2023 : опубл. 25.12.2023 / Е. А. Богатыренко, А. В. Ким, Д. В. Дашков [и др.]
2. Кокуркина, Ю. А. Углеводородокисляющие бактерии холодных морей / Ю. А. Кокуркина, Д. В. Дашков // Понт Эвксинский - 2023 : Материалы XIII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием для молодых ученых по проблемам водных и наземных экосистем, посвященной 60-летию со дня преобразования Севастопольской биологической станции в ИнБЮМ, Севастополь, 09–14 октября 2023 года. – Севастополь: ФИЦ "Институт биологии южных морей им. А.О. Ковалевского РАН", 2023. – С. 25-27.
3. Особенности окисления углеводородов нефти бактериями, выделенными из Японского моря / Е. А. Богатыренко, Д. В. Дашков, А. В. Ким, Т. И. Дункай // XXII Международная конференция по науке и технологиям Россия-Корея-СНГ = XXII International Conference on Science and Technology Russia-KoreaCIS : труды конференции, Москва, 25–27 августа 2022 года. – Новосибирск: Новосибирский государственный технический университет, 2022. – С. 37-41. – EDN OPXZKX.

Что предстоит делать:
В экспедиции:
1. Отбор проб поверхностных вод и донных отложений
2. Фиксация образцов поверхностных вод и донных отложений для последующей работы в лаборатории
3. Создание накопительных культур углеводородокисляющих микроорганизмов

В лаборатории:
Выделение тотальной ДНК и секвенирование маркерных генов

Методы, приборы, ПО, с которыми предстоит работать:
1. Методы отборы и фиксации проб поверхностных вод и донных отложений
2. Методы работы с питательными средами и накопительными культурами
3. Навыки работы с отечественной и иностранной литературой.

Обязательные требования:
опыт работы в микробиологической лаборатории
навыки приготовления питательных сред
аккуратность
Необязательные требования: Работа с Microsoft Excel и Microsoft Word, умение работать в Photoshop
Специализация, уровень образования: Биология, микробиология, экология, бакалавры, магистры 1 курс

Необходимые документы: справка от врача о состоянии здоровья, флюорография

Финансирование: проезд и проживание покрываются организаторами