Научно-образовательная программа «Плавучий университет» осуществляется при поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации и входит в список поддержанных инициатив Десятилетия наук об океане в интересах устойчивого развития (2021-2030 гг.) ООН.
Программа проходит на разных площадках по всей стране под руководством Координационного центра «Плавучий университет» на базе Московского физико-технического института.