С 2022 г. при финансовой поддержке Министерства науки и высшего образования РФ возглавила Всероссийскую научно-образовательную программу “Плавучий университет” и создала Координационный центр на базе МФТИ, на который обеспечивает реализацию программы и разработку новых инициатив. Цель Программы ПУ в долгосрочной перспективе - формирование единого профессионального трека от школьника до кандидата наук о естественно-научном направлении и морских науках в частности, а также развитие и поддержка всероссийского сообщества молодых ученых-океанологов.
С 2023 года Наталья Степанова возглавляет
Центр наук о Земле МФТИ, включающий три лаборатории: арктической океанологии под руководством д.ф.-м.н. Александра Осадчиева, машинного обучения в науках о Земле - к.т.н. Михаила Криницкого, динамики климата - д.ф.-м.н./д.г.н. Ольги Золиной.
С 2006 года ходит в морские научные экспедиции. В разные годы прошла путь от пролива Дрейка в Антарктике до Восточно-Сибирского моря в Арктике. С 2021 года является начальником нескольких арктических экспедиций.
В свободное время занимается фридайвингом.