Поиск новых генов опсинов двустворчатых моллюсков

судно: НИС «Профессор Молчанов»
отряд: гидробиологии
район исследований: Карское море, море Лаптевых
даты: июль-август 2024 г.

Актуальность задачи: Двустворчатые моллюски (Bivalvia) - класс беспозвоночных, известный с раннего палеозоя (более 500 млн. лет назад) насчитывающий около 20 тыс. видов.
Представители Bivalvia - чувствительные биосенсоры и биоаккумуляторы,
отличающиеся быстрыми эволюционными реакциями на изменения окружающей среды, что делает двустворчатых моллюсков интересными объектом для исследований.
Более детальное изучение уникальных механизмов адаптации двустворчатых моллюсков возможно через изучение мембранных белков этих организмов.
Опсины - фоточувствительные мембранные белки, относящиеся к классу GPCR (рецепторы, сопряженные с G-белком). Хорошо изучены опсины позвоночных, включенные в зрительную сенсорную систему, а также выполняющие различные невизуальные функции. Опсины беспозвоночных остаются малоизученными, и функции большинства из них не определены.
Данная научная работа направлена на поиск новых генов опсинов у двустворчатых моллюсков для дальнейшего исследования изменчивости этих белков внутри видов класса Bivalvia.

Полина Хорн, с.н.с., МФТИ(НИУ). У меня химическое высшее образование, несколько лет работала в химико-аналитической лаборатории фармацевтических компаний, в том числе проходила стажировку по тонкому органическому синтезу в научно-исследовательском центре Новартиса. Когда поступила в аспирантуру РАН, сменила область интересов на биофизику белков. Сейчас работаю в области структурной биологии рецепторов.

Опубликованные работы по теме задачи: По данной работе нет опубликованных данных. Но с актуальностью темы можно
ознакомиться по следующим работам:
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0025326X15302447?via%3Dihub
https://link.springer.com/article/10.1007/s10750-022-05057-7
https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/gb-2005-6-3-213

Что предстоит делать: Для работы необходимо будет собрать образцы двустворчатых моллюсков, провести фенотипический анализ собранных образцов, выделить геномную ДНК, провести анализ выделенной ДНК с использование специфических праймеров.

Методы, приборы, ПО, с которыми предстоит работать: Выделение ДНК из биоматериала различными способами (механические пипетки), подготовка ДНК для исследований (ламинарный бокс), анализ ДНК с помощью ПЦР (амплификатор), анализ ПЦР-продуктов с помощью ДНК-электрофореза в агарозном геле (аппараты для горизонтального гель электрофореза)

Обязательные требования: Навыки работы в лаборатории молекулярной биологии
Специализация, уровень образования: биология, химия бакалавры 3 курс и выше

Финансирование: проезд и проживание покрываются организаторами

Дополнительные документы: не требуются